Le mot certes est généralement précédé de la virgule lorsqu’il figure à la fin de la phrase :

Il est suivi d’une virgule en début de phrase lorsqu’il joue le rôle d’une charnière.

Dans le corps de la phrase, il est encadré ou non de virgules, selon la longueur de la phrase :

Renseignements complémentaires

voir ADVERBE (ADVERBE CHARNIÈRE + VIRGULE).