Il y a une distinction à faire entre les noms graine, noyau et pépin.

Graine

La graine est un terme générique désignant la partie de la plante qui garantit sa reproduction. Tous les fruits et les plantes contiennent au moins une graine. Le noyau et le pépin sont des graines.

Noyau

Un fruit a un noyau s’il ne contient qu’une seule graine. Le noyau est au centre du fruit et est très dur :

Ainsi, on écrit :

Pépin

On dit qu’un fruit a des pépins lorsqu’il contient plusieurs graines. Ainsi, les citrons, les melons, les oranges, les pommes, les poires, les raisins ont des pépins. On écrit des fruits à pépins, car il y a plusieurs pépins.